Új koronavírus-változat 501Y-V2 Dél-Afrika
2020. december 18-án Dél-Afrika az új koronavírus 501Y-V2 mutánsát észlelte.Mára a dél-afrikai mutáns több mint 20 országban terjedt el.Kísérletek kimutatták, hogy az új koronavírus mutánsai a K417N/T, E484K és N501Y más új koronavírus-változatait is hordozhatják, amelyek csökkenthetik a vakcina által kiváltott plazmaneutralizáló antitestek semlegesítő képességét.A Wuh01 referenciagenomhoz (szekvenciaszám: MN908947) képest azonban a dél-afrikai mutáns genomszekvencia 501Y.V2 szekvenciája 23 nukleotid variánst tartalmaz.Ugyanazt az N501Y mutációt tartalmazza, mint a brit mutáns B.1.1.7 altípusát, de még mindig tartalmaz mutációkat az S fehérje két kulcsfontosságú helyén, az E484K és a K417N, amelyek potenciálisan fontos hatással lehetnek a vírus fertőzési képességére.
Az új koronavírus egy egyszálú RNS vírus, amelynek genommutációi gyakrabban fordulnak elő.Az egycélú kimutatás könnyen vezethet az alacsony vírusterhelésű és mutált vírustörzsek kimutatásának elmaradásához.Az ismételt kivizsgálás aránya az egyetlen pozitívban a célfelderítésben elérheti a 10%-ot is, ami növelheti a munkaterhelést és meghosszabbíthatja a diagnózis idejét.A többcélú felismerés és az egyes célpontok eredményeinek kölcsönös ellenőrzése növelheti az észlelési arányt és megkönnyítheti a korai diagnózist.
1. ábra. Az új koronavírus fertőzési mechanizmus sematikus diagramja
Új koronavírus B.1.1.7 mutáns Nagy-Britanniából
2020. december 26-án megjelent az interneten az első tudományos közlemény a B.1.1.7 törzsről.Az Institute of Hygiene University of London és a Tropical Diseases megerősítette, hogy a B.1.1.7 törzs jobban képes terjedni, mint más törzsek, ami több mint 56% (95% CI 50-74%).Mivel ennek az új mutáns törzsnek nyilvánvalóbb az átviteli ereje, nehezebbé vált a COVID-19 ellenőrzése.Másnap az Egyesült Királyság Birminghami Egyeteme feltöltött egy cikket a MedRxiv-ről.A tanulmány megállapította, hogy a B.1.1.7 mutáns törzzsel fertőzött betegek ORF1ab és N vírus génkópiáinak száma (S-gén kiesés) jelentősen megnőtt;ezt a jelenséget követték nyomon a lakosság körében.Ez a cikk rámutat arra, hogy a brit B.1.1.7 mutánssal fertőzött betegeknél szignifikánsan nagyobb a vírusterhelés, így ez a mutáns patogénebb is lehet.
2. ábra: A brit B.1.1.7 koronavírus mutáns törzsben található genommutációs szekvencia
3. ábra: Az N501Y mutáció Nagy-Britanniában és Dél-Afrikában egyaránt előfordultVáltozatok
Új koronavírus-változatok észlelőkészlete
A Chuangkun Biotech Inc. sikeresen kifejlesztett egy kimutatási készletet a B.1.1.7 és 501Y-V2 új koronavírus-változatokhoz.
A termék előnyei: nagy érzékenység, 4 célpont egyidejű kimutatása, lefedve a B.1.1.7 mutáns törzs és az 501Y.V2 dél-afrikai mutáns törzs fő mutációs helyeit.Ez a kit egyidejűleg képes kimutatni az N501Y, HV69-70del, E484K mutációs helyeket és az új koronavírus S gént;Gyors teszt: mindössze 1 óra 30 perc telik el a mintavételtől az eredményig.
4. ábra: A COVID-19 brit variáns amplifikációs görbéjének észlelése
5. ábra: A COVID-19 dél-afrikai variáns amplifikációs görbéjének észlelése
6. ábra: Az új koronavírus vad típusú amplifikációs görbéje
Nem világos, hogy ezek a mutációk hogyan halmozzák fel a COVID-19 világjárvány új, hosszú távú hatásait.Ez azonban arra emlékeztet bennünket, hogy ezek a mutációk befolyásolhatják a természetes immunitás és a vakcinázás által kiváltott immunitás hatékonyságát.Arra is emlékeztet bennünket, hogy hosszú ideig folyamatosan figyelnünk kell az új koronavírust, és frissítenünk kell a COVID-19 oltóanyagot, hogy kezelni tudjuk az új koronavírus fejlődését.
Feladás időpontja: 2021. március 12